“卓尔”源自于《论语·子罕》：“颜渊喟然叹曰：“仰之弥高，钻之弥坚。瞻之在前，忽焉在后。夫子循循然善诱人，博我以文，约我以礼，欲罢不能。既竭吾才，如有所立卓尔，虽欲从之，末由也已。”卓尔园位于图书馆北侧与厚德大厦南侧中间位置，改造于2018年，面积4770平方米，主要由拱门、玻璃栈道、休闲座椅、廊架、座椅台阶、花钵、特色雕塑、水景喷泉、行道树、铺装等构成，铺装上预留历届“厦门工学院之星”获得者篆刻。卓尔园位于生活区和教学区的主要通道和核心区域，原为竹林，2018年改造后既保留了原有的自然韵味，又融入儒家思想，赋予卓尔园特殊的文化意义。
园内四块匾额“独立不迁”、“洵美且异”、“海日于瞻”、“山月可听”、“大道之行，天下为公”的设立，源于屈原《橘颂》、《诗经·静女》、《礼记·礼运》等处，符合孔子的基本思想，也蕴含了厦门工学院对办学、人才培养理念的坚守及对莘莘学子的殷殷期待。卓尔园的建立，不仅为师生提供休闲娱乐、学习诵读等场所，同时也以特殊的形式散发着精神文化的熏陶。
